Retour de disponibilité et congé maternité

Bonjour à tous,
Ma femme et moi nous retrouvons dans une situation un peu particulière et nous ne trouvons pas de réponses à nos interrogations. Elle était en disponibilité pour suivi de conjoint cette année et elle a muté (inter puis intra) pour me rejoindre. Entretemps elle est tombée enceinte. Elle sera dans son 3e trimestre mi septembre et la grossesse est à risque, elle est actuellement assez fatiguée et fait des malaises de temps en temps. Entre ça et le risque que l'épidémie reprenne, nous ne savons pas si elle fera la rentrée. Mais si elle est placée est arrêt maladie puis en congé maternité, est-ce qu'elle percevra son salaire ?
Je vous remercie beaucoup si vous pouvez nous éclairer
Guigues